Еще одна функция системного администратора -- модернизация системы и установка нового программного обеспечения.
Развитие системы Linux происходит довольно быстро. Новые версии ядра системы выходят через каждые несколько недель, и примерно с такой же частотой происходит модернизация другого программного обеспечения. Ввиду этого новые пользователи системы Linux считают, что им нужно постоянно проводить модернизацию системы для того, чтобы не отстать от всех. Это совершенно не обязательно делать, и такой поход является напрасной потерей времени. Если постоянно отслеживать все изменения, которые происходят в мире Linux, то все время будет уходить на модернизацию систему, а пользоваться ей будет некогда.
Есть мнение, что производить модернизацию нужно тогда, когда выходит новая версия (например, новая версия дистрибутива Slackware). Некоторые пользователи устанавливают свою систему полностью заново с каждым выходом нового дистрибутива Slackware.
Наилучший способ модернизации зависит от используемого дистрибутива системы Linux. Дистрибутивы Debian, SuSE, Caldera и Red Hat Linux имеют развитую систему поддержки пакетов программного обеспечения, что позволяет просто производить модернизацию путем установки нового пакета. Например, компилятор gcc для языка C выходит в виде пакета заранее собранных исполняемых файлов (pre-built binary package). При его установке на место всех файлов старой версии записываются файлы новой версии.
В большинстве случаев бессмысленная модернизация только ради того, чтобы "быть на уровне" , совершенно не требуется. Ситуация здесь отличается от ситуаций с системами MS-DOS или Microsoft Windows. Не имеет особого смысла использовать только новейшие версии всех программных средств. Производить модернизацию следует, когда новые свойства, которые есть в новой версии программ, действительно нужны для работы. Если они не нужны, производить модернизацию не нужно. Иными словами, модернизировать нужно только то, что необходимо, и только тогда, когда необходимо. Модернизация ради модернизации является простой потерей времени и усилий.